岩石
混杂在土壤中的石块可以提高土壤的排水、透气性能。性喜干燥的葡萄树通常喜爱生长在多石的土中。在勃艮第几乎毫无例外，所有顶尖的葡萄园内都含有相当比例的石灰岩块。
勃艮第葡萄园的黏土质多，但因多位于山坡上，土中含有许多石块，克服了土壤透气性与排水性不佳的缺点，在土中留下较多空隙，除了透气，也让雨水渗入底土，不会直接顺坡而下造成冲刷，使土壤流失。但岩石比例过高也有缺点，如缺乏土壤，有机质少，土地常会过于贫瘠，保水性不佳，在少雨的年份会有干旱缺水的问题。长在多石区的葡萄必须将根扎到更深的地底才能获得均衡的水分供给。
产自多石葡萄园的黑皮诺或霞多丽通常酒体比较细瘦，酸味也多一些，少见奔放的果香，常被本地的酒庄归为矿石系的葡萄酒。这类酒虽不一定有矿石香气，但白酒偏青柠檬味而少蜜瓜香气，红酒多野樱桃味而少黑樱桃香气。
不过，因为多石的葡萄园通常位于山坡顶端，比较高的海拔位置更增添了这样的风味。另外，一些位于向南坡的多石葡萄园也可能因为石头的吸热效果，让葡萄更成熟，酒体反而更丰满。
微生物与腐殖质
土壤中的腐殖质来自葡萄园内腐败的落叶或藤蔓等有机物质，但也可能来自人为的堆肥。腐殖质分解产生的二氧化碳、蛋白质、氮、磷钾、钙、铁等都是葡萄树的主要养分来源。
虽然葡萄树喜好贫瘠的土地，但仍需要适当的养分，土壤中的有机物质可以增加昆虫、细菌等土中生物与微生物的数量与活力，维持活的土壤生态环境。位于山脚下的土壤通常含有较多的腐殖质，特别是在由淤泥构成的平原区，腐殖质比例更高，土质常太过肥沃。腐殖质含量高的腐殖土保肥与保水性都不错，很适合一般作物的种植，但对于喜好贫瘠土地的葡萄来说比例却过高。
土壤微生物中，和植物形成共生关系的菌根菌影响最大。这些真菌类的细菌寄生在葡萄树的根部，其菌丝会在树根的皮层细胞内形成叉状分枝的丛枝体，并且产生囊泡。菌根菌能使土壤中的腐殖质分解，产生氮肥，并从土壤中吸收各种矿物质，以供给葡萄树的根部。而葡萄树则提供菌根菌所需的糖分和碳水化合物。
缺乏菌根菌的协助，葡萄很难从土壤中吸收生长所需的矿物质。化学肥料以及除草剂、杀菌剂等农药的使用，会让土壤失去平衡，微生物大量减少。不但菌根菌数量变少，菌种的多样性也会降低，在这样的土壤中施用再多的矿物质肥料也无法让葡萄生长得更健康，酿出更多变的葡萄酒。
通过菌根菌，葡萄可以从土壤中吸收数十种矿物质，但是人工供应的肥料却仅集中于氮磷和钾肥，无法真正满足葡萄的需求，很难酿造出复杂多变的葡萄酒。勃艮第有越来越多的酒庄采用有机或自然动力法来种植葡萄，对于这些方法是否能酿造出最精彩的葡萄酒也许有争议，但至少可以确定，这两种方法能让土壤更具生命力，保持数量更多、种类更多样的生物与微生物。
矿物质
土壤中所含的多种矿物质如氮、磷、钾钙、氟、镁、铁等，都是葡萄生长所需的重要物质。如钾有助于葡萄茎干的生长，磷有利于葡萄果实的成熟，氮可使叶片生长茂盛，镁有助于增加葡萄的糖分和降低酸味。土中的矿物质部分来自岩石本身，但也可能来自土中的腐殖质、菌根菌或人工肥料。和土中其他元素样，土壤中矿物质的含量必须均衡，才能让葡萄有最佳的表现，过多或不足都会带来麻烦。
勃艮第在20世纪70年代发生的钾肥害即是例。勃艮第的葡萄园已经历了一千多年的单作物耕作，土中有许多种矿物质已消耗殆尽，得依赖人工添加。谨慎的酒庄会先进行土质分析，再计划使用含有不同矿物质的肥料来补充土壤的肥力。
